A evolução das plantas através do estudo do genoma do feto.


Publicada em
Ciências da vida
.
Madrid
,
Quarta, Julho 18, 2018

Os fetos estão entre as plantas mais antigas da Terra. São fósseis vivos que datam de mais de 400 milhões de anos que souberam adaptar-se às diferentes mudanças climáticas e superar os eventos catastróficos que nosso planeta experimentou. Por estas razões, eles são interessantes para estudos evolutivos, embora o problema seja que possuem genomas muito grandes (12-14 Gb)

Graças à sequenciação SMRT de PacBio, poderíamos classificar os genes em ortogrupos de 23 genomas e reconstruir a evolução das famílias de genes: ganho, perda, expansão e contração de todo o ramo do reino vegetal. Uma das descobertas mais importantes foi ver que os genes que codificam os fatores de transcrição de sementes já estavam presentes nos genomas das plantas que não foram reproduzidos pelas sementes, indicando a importância da montagem completa e contígua do genoma para a descoberta precisa dos detalhes no genoma. 

Também foi possível correlacionar uma grande quantidade de RNA editado com a família de proteínas PPR, o que indica a importância de se poder ver fragmentos de grandes repetições dispostos em blocos sequenciais. Ou a presença de genes de resistência a insetos através da transferência horizontal de genes.

Finalmente, graças à sequenciação de fragmentos longos e contíguos, a história co-evolutiva da simbiose feto-cianobactéria pode ser avaliada. Foi determinado que a simbiose tem mais de 100 milhões de anos, provavelmente existindo antes da via da simbiose comum que é observada na maioria das plantas terrestres hoje. A ausência ou presença de bloqueios génicos nesses genes comuns (CSP) gerados pela simbiose também foram caraterizados, entre os quais se destacam, entre outros, a capacidade de amortecer os efeitos das flutuações na disponibilidade de azoto ambiental.

 

 

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